|
|
Карточка ресурса
← Вернуться
Количество посещений: 235
, за текущий год: 18
| Изучение вклада различных факторов дизайна праймеров в их эффективность при количественной полимеразной цепной реакции
|
| Праймеры являются ключевым фактором успешной количественной полимеразной цепной реакции. Качественный дизайн праймеров обеспечивает
высокую специфичность и эффективность. При разработке праймеров необходимо понимать, что изменение одного параметра праймера
повлияет на другие параметры. Проводили кПЦР следующих генов: IL1B, IL6, CXCL8, IL12A, IL23A, PECAM1, VWF, KDR, FAPA, ACTA2,
SMTN, VIM, COL4A1, MMP2, SNAI2, TWIST1, ZEB1, SCARF1, CD36, LDLR, VLDLR, VCAM1, ICAM1, SELE, SELP, CDH5, IL1R1, IL1R2, TNFRSF1A,
TNFRSF1B, NOS3, PXDN. Праймеры были разработаны in silico в программе Primer-BLAST. Коэффициент детерминации коррелировал
с количественной оценкой качества праймеров Beacon Designer. GC в обратном праймере коррелировал с температурой плавления.
Эффективность, напротив не коррелировала ни с содержанием GC, ни с Beacon Designer, однако коррелировала с длинной и содержанием
GC в обратных праймерах. Все указанные коэффициенты корреляции находились в диапазоне от 0,4 до 0,5 либо от -0,4 до -0,5,
отражая корреляционную связь средней силы. В то же время остальные параметры (как для пар, так и отдельно для прямого и обратного
праймеров) не влияли на эффективность и коэффициент детерминации кПЦР. Таким образом, при соблюдении основных правил дизайна
праймеров их параметры незначительно влияют на эффективность и коэффициент детерминации кПЦР.
|
| 2020
|
| Кемерово
|
| Профессиональный уровень/Высшее образование
|
| Любая
|
| Все
|
| Научные материалы/Выпускная квалификационная работа
|
| PDF
|
| Кемеровский государственный университет
|
| Научные
|
| Русский
|
| Общее образование
|
| Депозитарий КемГУ
|
| Для внутреннего использования
|
| 2020-07-07
|
| 2020-07-07
|
Получить в XML-формате
|
